6th Biennial Symposium of the International Society for River Science, 8-13 septembre 2019, Vienne, Autriche
The French-Swiss program SYNAQUA (INTERREG France-Switzerland 2017-2019) focused on the development and the validation of a genomic tool for water quality biomonitoring, based on diatoms and oligochaetes. One of the four work-packages of the program aimed to raise stakeholders and citizens‘ awareness of the readiness, the assets and the limitations of this novel tool. Three participative seminars were organized in Lyon and Paris during the first trimester of 2019. These seminars aimed to build an ideal but realistic scenario for implementation of the genomic tools in France. As England is the only country where genomic tool have already been implemented for water quality biomonitoring, the question of English experiences was often raised during the seminars. This poster presentation focuses on preliminary feedback from stakeholders on the implementation of genomic tools for water quality biomonitoring in England. We also present organization and stakeholders’ interactions both in France and England. We try to highlight the main differences between the two countries and to understand what could be implemented in France and, on the contrary, could or should not be implemented. English experiences, along with the analysis we made about it, could be useful to fuel reflection in France and other European countries where the EU Water Framework Directive applies.
35ème Colloque de L’ADLaF du 13 au 15 septembre 2016
Les sources hydrothermales terrestres et sous-marines sont nombreuses et de fonctionnement varié en Guadeloupe du fait de l’activité volcanique et de la nature altérée et fracturée du massif. Bien que les systèmes hydro-thermo-minéraux du massif de la Soufrière fassent l’objet d’un suivi physico-chimique depuis les années 1960 dans le cadre de la surveillance de l’activité volcanique réalisée par l’Observatoire volcanologique et sismologique de la Guadeloupe, les compartiments biologiques des sources hydrothermales de la Guadeloupe n’ont que très peu été étudiés. Sans prétendre à l’exhaustivité, une première étude[1] a permis d’explorer les principaux compartiments constituant le biofilm qui se développe dans et à proximité immédiate des sources guadeloupéennes : les diatomées,les bactéries, les cyanobactéries ainsi que les Archées. Dans un second temps, l’étude[2] des diatomées des sources hydrothermales de la Martinique est venue compléter les données acquises en Guadeloupe.
En ce qui concerne les diatomées, aucune étude naturaliste n’avait eu lieu depuis la mission P. Allorge en 1936 qui avait permis à Manguin et Bourrelly de décrire plusieurs taxons dont certains rarement observés depuis comme Navicula guadalupensis (Manguin in Bourrelly & Manguin) et Navicula thermophila (Manguin in Bourrelly & Manguin). Cette dernière est maintenant attribuée au genre Chamaepinnularia (C. thermophila (Manguin) C.E. Wetzel& Ector 2016). Compte tenu de l’évolution de la taxonomie, et à la lumière de nos observations réalisées en microscopie électronique, Navicula guadalupensis devrait maintenant appartenir au genre Microcostatus. Une espèce du genre Halamphora est potentiellement nouvelle pour la science.
Ces études ont permis de mettre en évidence la présence d’autres micro-organismes photosynthétiques ou non inféodés à ces conditions environnementales extrêmes et ont également révélé des interactions biologiqueset peut-être biochimiques originales (Cyanobactéries du genre des Plectonema associées à des bactéries sulfo-oxydantes du genre Thiomicrospira),ce qui confirme que les sources hydrothermales des Antilles françaises constituent un laboratoire naturel encore à explorer.
[1] Programme de recherche et de développement conduit en 2014 et 2015 par le consortium ASCONIT consultants, IRSTEA et Observatoire volcanologique et sismologique de la Guadeloupe, financé par l’Office de l’eau et le Parc National de la Guadeloupe.
[2] Programme de recherche et de développement conduit en 2015 par le consortium ASCONIT consultants, IRSTEA et BRGM, financé par l’Office de l’eau et la DEAL de la Martinique.
Colloque interdisciplinaire « Gestion intégrée des eaux : enjeux entre société et nature », les 6 et 7 décembre 2018 à l’Université de Lausanne – Faculté des géosciences et de l’environnement
(IdGene), J. PAWLOWSKI (Université de Genève), F. RIMET (INRA-CARRTEL), J.F.RUBIN (Maisonde la Rivière) & Estelle LEFRANCOIS
Demandant une évaluation du “bon état écologique” des “masses d’eau », la Directive Européenne Cadre Eau de 2000 et le « Système modulaire gradué » suisse (OFEPP, 1998) ont suscité un développement très conséquent des techniques de bioindication. Des progrès considérables ont ainsi été réalisés, mais on constate aussi des limites certaines tant d’un point de vue technologique que dans l’intégration de la bio-indication dans les processus de décision et de gestion nécessaire à une bonne gestion intégrée.
Le projet SYNAQUA a pour objectif d’adapter des outils génomiques basés sur l’ADN environnemental, à la bio-surveillance, tout particulièrement des eaux et des sédiments du Lac de Genève et des rivières transfrontalières. Pour ce faire, il regroupe des chercheurs, une start-up, des consultants et des associations d’éducation à l’environnement, dans le cadre de I’Interreg France-Suisse 2014-2020. Il a pour ambition de développer des outils de bioindication innovants, basés sur l’ADN environnemental d’organismes bioindicateurs, en collaboration avec les services publics et les instances de gestion et de contrôle des ressources en eau.
Les objectifs sont de répondre au mieux aux besoins opérationnels en offrant une méthode d’analyse fiable et innovante de la santé des écosystèmes et d’optimiser les pratiques de bio-surveillance. Le projet inclus un travail de concertation et de co-construction avec les utilisateurs et bénéficiaires directs de ces nouveaux outils (administrations et organismes publics, organismes de recherche et bureaux d’études, entreprises) en vue de l’implémentation de ces nouveaux outils dans la biosurveillance opérationnelle. La communication portera sur la méthodologie qui sera mise en œuvre au cours du premier semestre 2019, pour mener ce travail de concertation et de co-construction.
61thAnnual Gulf and Caribbean Fisheries Institute. November 10-14 2008
LefrançoisE., Coat S., Vachiery N., Gros O., Monti D. Sister relationships between coastal andfreshwater biota in Caribbeans: importance of autochtonous epilithic biofilm duringthe inland parts of species life cycles.